La reconstrucción de los principales acontecimientos desde el Vaticano II hasta el papa Francisco ayuda a conocer e interpretar la configuración una tercera Compañía, distinta de la Compañía restaurada y más parecida y afín a la de los padres fundadores. Pedro Arrupe (1965-1983), y su sucesor, Peter Hans Kolvenbach (1983-2008), marcaron las etapas de esta compleja y difícil transición. Con la llegada del primer papa jesuita, se han reencontrado con un nuevo protagonismo en la vida de la Iglesia. Han recibido del pontífice una misión específica: dar a conocer la práctica del discernimiento espiritual, instrumento para llevar a cabo aquella «conversión pastoral» que está en el corazón de la reforma de la Iglesia y tan presente en la encíclica programática de su pontificado, la Evangelii gaudium.