Los ejercicios espirituales son un elemento esencial de la espiritualdad y misión Verbum Dei. Suponen un tiempo prolongado de oración en retiro en una dinámica orientada claramente hacia la conversión, la profundización en la vida espiritual según el Evangelio y la revitalización misionera y apostólica. El manual consta de dos partes: la primera, "Los prolegómenos", donde se proponen las líneas esenciales de los Ejercicios Espirituales Verbum Dei; y la segunda, donde se ofrecen estos principios de forma aplicada.